Десять лет минуло с тех пор, как Нагатэ Таникадзэ отбил атаку Гауна и спас «Сидонию», последний оплот человечества. С тех пор жители корабля живут в относительном покое и изо дня в день наслаждаются мирной жизнью. Однако в глубине сердца Цумуги Сирауи всё сильнее просыпается чувство к Нагатэ, которого сейчас чествуют как героя и символ надежды. Но капитан Кобаяси знает истину: пока где‑то во Вселенной существуют Гауна, мир не может длиться вечно. Надвигается последняя битва, исход которой определит судьбу всего человечества. В этом финальном противостоянии рыцари «Сидонии» смогут ли они сохранить планету и защитить тех, кого любят, столкнувшись с неотвратимыми потерями и тяжёлым выбором? Время неумолимо поджимает, а прошлое и долг каждого члена команды переплетаются с будущим всего человечества.
