В недалёком будущем над просторами мирового океана рождается новый конфликт. Зловещая сила подводного мира — организация USR, расшифровываемая как Undersea Silence Revolution — стремится перевернуть баланс сил в глубинах морей. Её во главе стоит Адмирал Ред — властолюбивый стратег, мечтающий о полном господстве над всем подводным пространством. Чтобы противостоять угрозе, решается создать Объединённый Флот Peace Keep Navy (PKN). Во время торжественной церемонии спуска на воду новых кораблей, за исключением медлительной подводной лодки 707, Ред наносит дерзкий удар, надеясь застать врага врасплох. Но вмешательство единичной, но стойкой 707 разрушает его планы: флот противника оказывается полностью открытым, однако капитан 707 не позволяет атаке увязнуть и добивает флагман на подходе к цели, вынуждая противника отступить. Спустя год 707 восстанавливают, а спасшаяся команда прежней подлодки во главе с капитаном Хаями вновь выходит в море, чтобы присоединиться к основному флоту под руководством новейшей американской подводной силы — Great Guardian. Пока 707 остаётся не в строю, Адмирал Ред наносит удар по силам союзников, и поражение оказывается близким: даже легендарная Great Guardian погибает до начала боевых действий. Но именно к финалу противостояния 707 подводит итог на своей стороне: её появление на арене решает исход схватки и определяет дальнейшую судьбу флотов. Ред, увидев в Хаями достойного соперника, признаёт в нём единственного достойного противника, способного поставить крест на его грандиозных амбициях.
