Когда на мир опустились неведомые существа, которых впоследствии стали называть драконами, облик действительности переменился до неузнаваемости. Вскоре после этого на свет стали являться девушки, наделённые уникальной силой: они способны управлять драконами, и такую способность назвали «Д». Именно для таких девушек был учреждён факультет и филиал — женская академия Мидгар. В этот учебный мир вступает Ю Мононобэ — единственный юноша, владеющий «Д», чья сила и существование надёжно скрыты от посторонних глаз. Но уже в первый день он попадает в неловкую историю: сталкивается с одной из учениц по имени Ирис и обнаруживает себя в весьма некомфортной ситуации. Со временем он узнаёт, что в том же учебном заведении учится и Мицуки — его младшая сестра, с которой они были разлучены в детстве, и её возвращение заставляет героя взглянуть на прошлое и поставить под сомнение судьбу будущего.
