Главный герой вдруг осознаёт, что его быт состоит из бесчисленных смертей и повторных возрождений, случавшихся почти на глазах у него и окружавших его таинственной силой возрождения. Он начинает понимать, что каждое возвращение к жизни несло в себе не случайность, а скрытую программу, которая соединяет его с загадочным механизмом мира. Постепенно он проливает свет на связь между собой и темным источником силы, который стоит за многочисленными духами, и учится распознавать истинную роль Куруми — не просто противника, а ключевой фигуры в распутывании древней тайны. Цель Куруми оказывается гораздо сложнее обычной битвы: уничтожить первоначального духа и тем самым освободить мир от страданий, принесённых его появлением. Шидо же считает, что часть его воспоминаний может стать звеном, объясняющим, каким образом он переплетается с загадкой этого первоисточника духа. В это время начинается глобальная кампания DEM — Deus Ex Machina Industries, которая разворачивает наступление на Рататоск с амбициозной миссией: заполучить власть над силами всех духов и заставить их служить своим интересам.
