Прошли годы с тех пор, как развернулась история The Fruit of Grisaia. Раньше тихая Академия Михама, укромный приют для юных девушек, теперь преобразована в тренировочную базу SORD — Специализированной организации исследований и разработок, нацеленную на подготовку кадров для обеспечения национальной обороны. Рена Фуками и Маки Инхара овладели искусством обращения с огнестрельным оружием; Тока Шишигая и Гуми — мастерицы снайперской стрельбы; Крис отвечает за взрывчатку и анализ данных; Мурасаки Икома — искусная ниндзя, руководящая разведывательными операциями. Вместе они берутся за задачи, которые оказываются за гранью возможностей полиции и сил самообороны, постоянно оказываясь на грани смертельно опасных миссий. Это история этих юных героинь, рассказанная кровью и порохом.
