Сюжет разворачивается в ближайшем будущем, когда Британия захватила значительную часть мировых территорий. Япония исчезла с политической карты: её земли оказались под властью империи и переименованы в 11-й сектор; жители Японии стали называть себя «одиннадцатыми» в уничижительной манере. Главный герой, Лелуш Ламперуж, изгнанный принц имперской династии, сослан вместе с сестрой в этот сектор и поступает в академию для местной знати. По стечению обстоятельств он оказывается втянут в поход японских повстанцев на Британию. Империя, не терпящая неповиновения, немедленно высылает карательные отряды, сносящие всё на своём пути. Спасаясь от преследователей, Лелуш встречает таинственную зелёноволосую девушку по имени С.С. Загнанная в угол и окружённая солдатами, С.С передаёт ему Великий дар — гиас. Так начинается новый виток борьбы, и Империя узнаёт цену своих преступлений.
