Прошло уже два года с тех пор, как произошли последние события. Дороги Ёродзуи разошлись: Гинтоки бродит по загадочной Альтане, Кагура ищет в бесконечном космосе способ вернуть Садахару к прежнему облику, а Шинпачи изо всех сил держится за то немногое, что осталось от их общего дома. Но над их миром снова нависла тревога: остатки Тендошу, поддерживаемые дерзкой атакой банановой шайки Гориллы, обрушиваются на Центральный терминал и замышляют снова использовать Альтану в своих целях. Настал момент, когда друзья должны в последний раз поднять щиты Эдо, чтобы воплотить в жизнь пожелание Шоё Йошиды и тем самым спасти своё будущее. Им предстоит пройти через испытания и сомнения, чтобы не потерять друг друга и дом, к которому они привыкли. Их путь снова переплетается между прошлым и будущим, подготавливая сцену для финального столкновения и судьбоносного выбора ради Эдо и мира вокруг.
