Во второй части аниме «Нелюдь» повторно освещаются ключевые события, завершившие первый сезон — последние семь серий — и первый эпизод второго сезона, связывая их в единое продолжение. Главный герой Кэй Нагаи, наконец, вырывается из заключения в лаборатории Комитета по контролю за нелюдьми и находит место, где может перевести дух и обдумать будущую судьбу. За кадром развивается политический кризис: Сато выходит на эфир и требует от властей признания прав нелюдей, обещая одиночными шагами привести к хаосу, если требования не будут удовлетворены. Он не остановится перед применением насилия ради своей цели. В атмосфере надвигающегося конфликта Кэю придется сделать трудный выбор: присоединиться к попытке прекратить Сато и защитить людей от его планируемых атак, или продолжать скрываться ради собственного выживания и поиска нового безопасного убежища. Фильм строит напряжение на грани между альянсом и противостоянием, заставляя зрителя гадать, как дальше разрешится противостояние между человеком и нелюдем.
