История фильма открывается с момента, когда Такато получает своего дигимона по имени Гилмон. Собираясь на каникулы в солнечную Окинаву, он берет с собой верного цифрового друга. На острове герой знакомится с ещё одним укротителем — Минами, с которым у него возникает новая волна эмоций и испытаний. Пока они наслаждаются отдыхом на побережье, в Японии случается непредвиденное: популярный цифровой питомец превращается в вирус, который стремительно заражает тысячи компьютеров. Разобравшись в причинах загадочного заражения, Такато пытается понять, как связаны Гилмон и происходящее, и почему остальные дигимоны относятся к его другу с враждебностью. Герой сталкивается с вопросами доверия и выбора, а также с тем, как дружба между человеком и дигимоном может оказаться ключом к остановке надвигающейся цифровой катастрофы.
