Смотреть Аниме «Индекс волшебства: Чудо Эндимиона»

Действие разворачивается сразу после завершения проекта космического подъёмника Эндимион, который должен был связать Академия-Сити с другими мирами, и город сталкивается с новыми испытаниями. Главный герой Тома Камидзё вместе с подругой Индекс внезапно выходят на след загадочной Арисы Мэйго — эспера нулевого уровня, чья сила пока не укладывается в рамки знакомых правил. По неизвестной причине Ассоциация Магов начинает охоту на Арису и наносит удар по городу, подрывая спокойствие жителей и ставя под угрозу весь баланс между наукой и магией. Чтобы защитить население и не допустить разрушительного конфликта, в городе возникает подпольное движение сопротивления, возглавляемое таинственным лидером Шатауры Секвенцией, которое пытается остановить наступление сил Магии. По мере развития сюжета герои узнают от Стэйла Магнуса, что Ариса может оказаться ключом к эскалации войны между двумя мирами: Магией и Наукой. Её участие обещает непредсказуемые последствия и риск полного разрыва между цивилизациями.