В 2002 году Морской экспресс — первый подводный поезд, соединяющий Америку и Японию, готовится к своему дебютному рейсу. Главный инженер подозревает, что пробный запуск может быть использован во зло и нанимает частного детектива Бан Шунсуку Бан, чтобы предотвратить злоупотребления. Бан прибывает в особняк своего заказчика, но обнаруживает, что тот только что был убит. Увидев лишь смутное лицо убийцы, Бан обращается к Морскому экспрессу, чтобы добраться до сути тайны. Однако эта работа оказывается гораздо сложнее, чем он ожидал: поезд хранит тайны, которые трудно представить. По мере продвижения расследования каждая остановка экспресса приносит новые улики и новые угрозы, и Бан понимает, что в игре не просто преступление, а борьба за выживание на фоне непроглядной глубины и неслыханных тайн.
